バージョンを確認してください。それが役立つかもしれません。
私も同じ問題を抱えていました。私の場合、サーバーはバージョン3.2.0-rc2でしたが、mongoシェルのバージョンは3.2.1でした。
サーバーを3.2.1にアップグレードすると、問題が修正されました。
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