Robomongo：$groupのメモリ制限を超えました

{ allowDiskUse: true } 

集約パイプラインの直後に配置する必要があります。

あなたのコードでは、これは次のようになります：

db.getCollection('RAW_COLLECTION').aggregate([
  // Group on unique value storing _id values to array and count 
  { "$group": {
    "_id": { RegisterNumber: "$RegisterNumber", Region: "$Region" },
    "ids": { "$push": "$_id" },
    "count": { "$sum": 1 }      
  }},
  // Only return things that matched more than once. i.e a duplicate
  { "$match": { "count": { "$gt": 1 } } }
], { allowDiskUse: true } )

注：{ allowDiskUse: true }を使用する アグリゲーションパイプラインはディスク上の一時ファイルのデータにアクセスするため、パフォーマンスに関連する問題が発生する可能性があります。また、ディスクのパフォーマンスとワーキングセットのサイズによっても異なります。ユースケースのパフォーマンスをテストする