bashスクリプトを介してMongoコマンドを実行すると、クエリの実行に失敗しました

それはJavaScriptではありません。 javascriptから外部実行可能ファイルを呼び出すことはできません。

mongorestoreを実行するだけです 直接：

mongorestore --host=localhost --port=27017 --gzip --archive=C:\backup --nsInclude 'n2aenv.*' --nsFrom 'n2aenv.*' --nsTo 'newDB.*'