タイプとサブタイプを次のような配列に格納するだけです。
doc1 = {
"_type": ["animal"],
"name": ...
}
doc2 = {
"_type": ["animal","dog"],
"name": ...,
"barkFile": ...
}
doc3 = {
"_type": ["animal","dog","poodle"],
"name": ...,
"barkFile": ...,
"haircut": ...
}
このモデルを使用して、クエリdb.data.find({_type:"dog"})
doc2とdoc3の両方を返します。