ドット表記を使用する必要があります:
foreach($horses as &$horse)
{
$newdata=array('$set'=>array('horses.odds'=> array($horses['odds'] => $price)));
$filter=array("marketId"=> $marketId);
$c->update($filter,$newdata);
}
http://www.mongodb.org/を参照してください。 display / DOCS / Dot + Notation +%28Reaching + into + Objects%29 。