Node.JSとMongooseを使用してMongoDBから単純な配列にデータを取得するにはどうすればよいですか？

$unwind オペレーター。これにより、アンワインドが適用されるリストデータフィールドのすべての要素に対して新しいレコードが生成されます。基本的にデータをフラット化します。

データをフラット化した後、 $lookup productsで「結合」を行う演算子 productsへのフィールド コレクション。ネストされたフルーツスキーマに対してこのプロセスを繰り返します。

これをよりよく理解するための例（未テスト）を見てみましょう

var Schema = require('../model/schema');
Schema.Shop.aggregate([
    { "$unwind": "$products" },
    {
        "$lookup": {
            "from": "products",
            "localField": "products",
            "foreignField": "_id",
            "as": "product"
        }
    },
    { "$unwind": "$product" },
    { "$unwind": "$product.fruits" },
    {
        "$lookup": {
            "from": "fruits",
            "localField": "product.fruits",
            "foreignField": "_id",
            "as": "fruits"
        }
    },  
    {
        "$project": {
            "nameShop": 1,
            "nameProduct": "$product.nameProduct",
            "nameFruit": "$fruits.nameFruit",
            "price": "$fruits.price",
        }
    }
]).exec(function (err, result){
    if (err) throw err;
    console.log(result);
})

免責事項 ：上記はテストされていないコードであり、 $lookup 演算子ANDは、mongoシェルで同じ集計クエリを実行できることを意味します。