Oracleがインデックスを作成するか、既存のインデックスを使用できます。一意のインデックスを使用するか、非一意のインデックスを使用するかはあなた次第です。
http://docs.oracle.com/cd/B28359_01/server.111/b28310/indexes003.htm#i1006566
主キー自体はインデックスではなく、一意の制約でもありません。どちらも制約です。ただし、それらをサポートするためにインデックスが使用されます。
一意のインデックスは、一意または主キーの制約がない場合に存在する可能性があるため、かなり異なります。どちらの制約タイプでも、それをサポートするインデックスが一意である必要はありません。