これを追跡するための内部MySQLコマンドはありません。少し抽象的すぎます。ファイルは5つ（またはそれ以上？）の場所にある可能性があり、カスケードをロードするため、すべて有効です。
- /etc/my.cnf
- /etc/mysql/my.cnf
- $ MYSQL_HOME / my.cnf
- [datadir] /my.cnf
- 〜/ .my.cnf
これらは、MySQLが参照するデフォルトの場所です。複数が見つかった場合は、それぞれをロードし、値は相互にオーバーライドします（リストされている順序で、私は思います）。また、--defaults-file パラメータはすべてを上書きできるので...基本的に、それはお尻の大きな痛みです。
しかし、非常に混乱しているため、/ etc/my.cnfにある可能性が高いです。
（値を確認したいだけの場合： SHOW VARIABLES
、ただし、そのためには権限が必要です。）