プリペアドステートメントから自動インクリメントIDを取得する方法はありますか

はい。 こちら を参照してください。 。セクション7.1.9。コードを次のように変更します：

String sql = "INSERT INTO table (column1, column2) values(?, ?)";
stmt = conn.prepareStatement(sql, Statement.RETURN_GENERATED_KEYS);


stmt.executeUpdate();
if(returnLastInsertId) {
   ResultSet rs = stmt.getGeneratedKeys();
    rs.next();
   auto_id = rs.getInt(1);
}