SELECTクエリは各グループから1行を返します

これを解決するための多くの選択肢があります。私がお勧めするのは、最新のIDを個別に取得するサブクエリに参加することです。 （列がAUTO_INCREMENTであると仮定します ed ）各store_ID 。

SELECT  a.*
FROM    tableName a
        INNER JOIN
        (
            SELECT  store_ID, MAX(ID) max_ID
            FROM    tableName
            GROUP BY store_ID
        ) b ON a.store_ID = b.store_ID AND
                a.ID = b.max_ID

• SQLFiddleデモ

パフォーマンスを向上させるには、次の列にインデックスを付けるようにしてください：ID およびstore_id 。

アップデート1

すべてのレコードに制限を設ける場合は、以下を使用してください。

SELECT ID, product_Name, store_ID
FROM   tableName a
WHERE
  (
     SELECT COUNT(*) 
     FROM   tableName b
     WHERE  b.store_ID = a.store_ID AND b.ID >= a.ID
  ) <= 2;

• SQLFiddleデモ