INSERT ... ON DUPLICATE KEY UPDATE with WHERE？

IF（）を使用してそれを行うことをお勧めします。

参照： conditional-duplicate-key-updates-with-mysql

INSERT INTO daily_events (created_on, last_event_id, last_event_created_at)
  VALUES ('2010-01-19', 23, '2010-01-19 10:23:11')
ON DUPLICATE KEY UPDATE
  last_event_id = IF(last_event_created_at < VALUES(last_event_created_at), VALUES(last_event_id), last_event_id);