SQLのUNIONの後のWHEREステートメント？

UNIONの結果にWHERE句を適用する場合は、FROM句にUNIONを埋め込む必要があります。

SELECT *
  FROM (SELECT * FROM TableA
        UNION
        SELECT * FROM TableB
       ) AS U
 WHERE U.Col1 = ...

TableAとTableBはユニオン互換であると想定しています。もちろん、UNIONの個々のSELECTステートメントのそれぞれにWHERE句を適用することもできます。