はい、必要に応じて、使用済みの下着のようなエンジンを問題なく交換できます。 phpmyadminで変更するだけです。
しかし、私はそれを変更するためにそれを変更しません。外部キーを使用する必要がありますか？それを変更。テーブルロックの代わりに行レベルのロックが必要ですか？それを変更。
MyISAMを使用する正当な理由もあることは注目に値します。 FULLTEXTの索引付けを見てください。 InnoDBではそれを行うことはできません。
更新
MySQL 5.6以降、FULLTEXTはInnoDBテーブルにも実装されています。これが