Perlでのクロール中にMySQLサーバーが消えました

最新のDBIとDBD::mysqlを使用していますか？ mysql_auto_reconnectが有効になっている必要があります。

フォークの下でmysqlを使用している場合は、設定が必要になる場合があります

$dbh->{InactiveDestroy} = 1;