phpとmysqlを使用して複数のチェックボックス値をデータベースに保存します

列を「set」（可能なすべての値を指定）データ型として設定し、以下のクエリを実行します。

$comma_separated = implode(",", $values);
$insert_query = "INSERT INTO TABLE_NAME(col_name) VALUES('$comma_separated')";
$result_insert = mysql_query($insert_query);

これで問題が解決することを願っています。