試すことができること：
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setMaxWait(-1)BasicDataSourceで。これは、接続を無期限に待機するように指示します。 -
wait_timeoutを確認してください MySQLサーバーではデフォルトの8時間に設定されています。 -
?autoReconnect=trueを設定します JDBCURLで -
setTestOnBorrow(true)BasicDataSourceで。これにより、古い接続が渡されるのを防ぐことができますが、アプリにオーバーヘッドが追加されます（ただし、このような長い単一のクエリを既に取得している場合は、おそらくその部分に気付くことさえありません）。
一般的に、接続を再利用し続けるのは悪い考えだと思います。私にとって、プールを持つことのポイントは、私がそれをする必要がないということです。
クエリはトランザクションですか？本当に長いクエリがメジャーテーブルをロックしているのでしょうか？