チェックボックスに次のような名前を付けます:
<input type="checkbox" name="chk[]" value="1" />
<input type="checkbox" name="chk[]" value="2" />
など。ここで、値はTable1のIDです。ユーザーが送信ボタンを押すと、POSTにはチェックされたチェックボックスの値が含まれます。
PHPでは、次のようになります
$chkArr = isset($_POST['chk']) ? $_POST['chk'] : array();
$chkArrCSV = implode(',',$chkArr);
次に、次のようにクエリを作成できます
$sql = 'SELECT blah FROM blah WHERE id IN '.mysql_real_escape_string($chkArrCSV);
その他、ユーザー入力をサニタイズするために必要なものは何でも。