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ページを介してmysql接続を開いたままにしておくのは完全に無謀ですか？

はい、毎回接続するオーバーヘッドはかなりのものになります。完了したら閉じることをお勧めします。クエリを実行せずに接続を開いているだけで脆弱性が発生する可能性はほとんどありません。