mysqlの単一クエリで2つのテーブルを更新します

ドキュメントで説明されているように、マルチテーブルアップデートで可能になるはずです。

http://dev.mysql.com/doc/refman/5.5 /en/update.html

UPDATE supply a INNER JOIN equipment b ON (a.IAR_NO= b.IAR_NO)
SET a.IAR_NO =  "9" , b.IAR_NO =  "9"
WHERE equipment.IAR_NO = 0 and supply.IAR_NO = 0;

注：

同じデータで2つのテーブルを更新する場合は、データベースを設計するためのより良い方法がおそらくあります。プログラミングは忘れずに DRY 。