クエリが実行されたら、接続を破棄する必要があります。
var knex = new Knex(config)
knex(table)
.where({ id: 1 })
.then((result) => {
callback(output)
})
.catch((err) => {
err.error = true
callback(err)
})
.finally(() => {
knex.destroy()
})
})