Mysqlは2つのテーブルを結合します。

金額を合計する前にすべての支払いレコードをすべての販売レコードと結合しているため、支払い金額に販売レコードの数を掛けています。

最初に集約し、次に参加するだけです。

日付、時刻、名前ごとに常に1つの支払いレコードしか存在できない場合：

select p.name, p.time, p.name, s.sales_total, p.amount
from payments p
join
(
  select date, time, name, sum(total) as total
  from sales
  group by date, time, name
) s
 on s.date = p.date and s.time = p.time and s.name = p.name
where p.date = date '2017-04-01';

それ以外の場合：

select p.name, p.time, p.name, s.total, p.amount
(
  select date, time, name, sum(amount) as amount
  from payments
  group by date, time, name
) p
join
(
  select date, time, name, sum(total) as total
  from sales
  group by date, time, name
) s
 on s.date = p.date and s.time = p.time and s.name = p.name
where p.date = date '2017-04-01';