JPAネイティブクエリは単一のオブジェクトを取得します

JPAを使用すると、次のようにする必要があります

int num = ((Number)this.entityManager.createNativeQuery("select count(*) from your_table_name")
                .getSingleResult()).intValue();

編集済み：

 String name = this.entityManager.createNativeQuery("select t.name from your_table_name t limit 1").getSingleResult().toString();

numオブジェクトでカウントされます

お役に立てば幸いです。