あなたのエンコーディングはMySQLWorkBenchではサポートされていないに違いありません。
.sqlファイルを保存するときにエンコーディングを変更できます。
- [ファイル]|[Save.sql]を選択して、[名前を付けて保存]ダイアログを呼び出します。
- 右下の[保存]ボタンには、オプションを示すドロップダウンアイコンがあることに注意してください。
- ドロップダウンアイコンを選択し、[エンコードで保存]コンテキストメモリアイテムを選択します。
- MySQLWorkbenchで機能するエンコーディングを選択します。