2つの条件でカウントを取得するためのネストされたクエリ

列infectionをグループ化する必要があります および（ip ＆ipc ）別の方法で、次のようなサブクエリを使用してそれらを結合します：

SELECT t1.ip, t1.isp, t2.infection, t1.ipc, t1. ispc, t2.incount
FROM
    (SELECT ip, isp, infection, COUNT(ip) as ipc, COUNT(isp) as ispc
    FROM (
       SELECT ip, isp, infection
       FROM tbl1
       UNION ALL
       SELECT ip, isp, infection
       FROM tbl2
       UNION ALL
       SELECT ip, isp, infection
       FROM tbl3
       )x
     GROUP BY ip, isp) t1
JOIN
    (SELECT ip, isp, infection, COUNT(infection) as incount
     FROM (
       SELECT ip, isp, infection
       FROM tbl1
       UNION ALL
       SELECT ip, isp, infection
       FROM tbl2
       UNION ALL
       SELECT ip, isp, infection
       FROM tbl3
       )x
    GROUP BY ip, isp,  infection)t2
ON t1.ip = t2.ip
ORDER BY ip, isp, infection Desc

このSQLFiddleを参照

注： 次の理由により、目的の出力が間違っていると思います。

1. Table3内 infectionはありません ip=6の場合 しかし、それはあなたの出力にあります
2. infection other 出力に欠落しています（代わりにmalwareがあります ）