MySQLクエリ、COUNTおよびSUM、2つの結合されたテーブル

集約されたフィールド以外のものを選択していないので、groupbyを実行する必要はありません。私はmysqlの専門家ではありませんが、これでうまくいくはずです：

SELECT count(d.id) as count, sum(d.url_count) as total from domains as d
inner join backlinks as b 
on b.domain_id = d.id 
 Where d.Link_found = 1  and b. is_homepage = 1