私が考えることができる唯一のことは、mysqldがユーザーrootとしてstraceを使用して実際に何をしているのかを調べることです:
strace -p 2959
通常、mysqldは接続を待機している必要があるため、straceはすぐにブロックし、select()の呼び出しを表示する必要があります。
呼び出しは次のようになります:
select(SOCKETNO, [OTHER_FDs], NULL, NULL, NULL)
特に重要なのは、タイムアウト時間値である4番目のパラメーターです。 NULLの場合、誰かが接続するまでmysqldがスリープすることを意味します。 NULLでない場合は、mysqldが指定された時間待機してから、メンテナンス作業を行うことを意味します。非常に短いタイムバルブは、CPU消費を説明する可能性があります。
MySQLは常にNULL(無限)タイムアウトを採用していると思います。それは理にかなっており、これが私が今到達できるmysqldsがどのように動作しているかです。
ただし、selectが再びスリープしないようにする接続処理の問題がある可能性があります。この動作がmysqldの起動直後に表示されるのか、誰かが接続した後に表示されるのかを確認してください。