AndroidでProguardとSQLcipherを使用しようとしているときにNoClassDefFoundErrorを取得する

クラスはProguardShrinkingツールによって削除されたと思います。

次のパラメータを追加してみてください

-dontshrink

それが機能するかどうか教えてください。

また、保護されたSqlcipherクラスに属性がないこともわかりました：

: E/AndroidRuntime(18993): Caused by: java.lang.NoSuchFieldError: no field with name='nHandle' signature='I' in class Lnet/sqlcipher/database/SQLiteCompiledSql;

保護されたクラスをSqlcipherから保護することもできますか？

-keep class net.sqlcipher.** {
    *;
}

P.S構成に-dontobfuscateオプションがあるのは定期的ですか？アプリケーションを保持しておけば、アプリケーションが難読化されることはありません。