正解です。System.Dataはありません（WinRTを最初にいじり始めたときに同じものを探しました）。あなたもそれを参照することはできません。 SQLデータベースと通信する場合は、他の種類のプロトコル（WebService、SOAP、WCFなど）を使用する必要があります。
ローカルDBオプションを提供するが、DBにアクセスするために何らかの仲介者を使用せずにサーバーベースのオプションを提供しないSQLite用のポートが利用可能です。
ちなみに、私は個人的に、たとえばSQL Expressデータベースに接続できるデスクトップMetroアプリを見たかったのですが、現在、フープを飛び越えずにカードに含まれていません。