DROPDATABASE に関するMSDNドキュメント これは、ファイルを削除せずにデータベースを削除することについて述べています（一般的な注意事項の下）：
したがって、sqlcmdを使用してファイルを削除せずにデータベースを削除するには、次のように変更できます。
sqlcmd -U sa -P MyPassword -S (local) -Q "EXEC sp_detach_db 'MyDB', 'true'"
免責事項：正直なところ、これまでsqlcmdを使用したことはありませんが、使用方法の構文から、これが問題の解決に役立つと思います。