私があなたの要求を正しく理解していると仮定すると、あなたが必要としているのはこれらの線に沿ったものだと思います:
SELECT "periods"."start_date",
"periods"."end_date",
SUM(CASE WHEN "balance_transactions"."created" BETWEEN "periods"."start_date" AND "periods"."end_date" THEN "balance_transactions"."fee" ELSE 0.00 END) AS period_sum
FROM "balance_transactions"
JOIN charges ON balance_transactions.source = charges.balance_id
JOIN ( SELECT '2013-12-20'::date as start_date, '2014-01-19'::date as end_date UNION ALL
SELECT '2013-12-21'::date as start_date, '2014-01-20'::date as end_date UNION ALL
SELECT '2013-12-22'::date as start_date, '2014-01-21'::date as end_date UNION ALL
SELECT '2013-12-23'::date as start_date, '2014-01-22'::date as end_date UNION ALL
SELECT '2013-12-24'::date as start_date, '2014-01-23'::date as end_date
) as periods
ON "balance_transactions"."created" BETWEEN "periods"."start_date" AND "periods"."end_date"
WHERE "balance_transactions"."account_id" = 6
AND "balance_transactions"."type" = 'charge'
AND "charges"."refunded" = false
AND "charges"."invoice" IS NOT NULL
GROUP BY "periods"."start_date", "periods"."end_date"
これにより、1つの結果セットに関心のあるすべての期間が返されます。クエリはフロントエンドでオンザフライで「生成」されるため、期間部分に必要な数の行を追加できます。
編集:試行錯誤を繰り返しながら、[sqlFiddle] [1]で動作させることができ、それに応じて上記の構文を更新しました。