PostgreSQL：別々のスキーマで2つのテーブルを結合するとパフォーマンスが低下します

いいえ、スキーマは単なる名前空間です。

テーブル（またはそのインデックス）が異なるテーブルスペースに格納されている場合、パフォーマンスが異なる場合があります。 1つのテーブルスペースは高速ストレージデバイス上にあり、もう1つは低速ストレージデバイス上にある可能性があります。しかし、それはあなたの選択であり、スキーマとは何の関係もありません。