ですから、インポートの方法が間違っていたことがわかりました。
ただし、基本的に、インポートは次のようになります。
import clr
import sys
sys.path.append(os.path.abspath('./DLL')) #where your dlls are
clr.AddReference('System')
clr.AddReference('FluentNHibernate')
from FluentNHibernate.Cfg.Db import PostgreSQLConfiguration
別のDLLがCLRにDLLをインポートする場合、DLLをインポートする必要はありません。