この方法で試すことができます
UPDATE wp_postmeta t JOIN
(
SELECT p.meta_id, m.newmap
FROM wp_postmeta p JOIN wp_map m
ON p.meta_value = m.oldmap
ORDER BY p.meta_id
LIMIT 100
) s
ON t.meta_id = s.meta_id
SET t.meta_value = s.newmap;
これが