これにはphpmyadminを使用しないでください。mysqldumpを使用する必要があります。コマンドラインからその
mysqldump -uMYSQL-USER -h server -pMYSQL-USER database_name > /path-to-export
PHPスクリプトから
$command = "mysqldump -uMYSQL-USER -h server -pMYSQL-USER database_name > /path-to-export/file.sql";
exec($command, $output, $return_var);
これはcronジョブで簡単に自動化できます