$lookupが空の配列を返す

条項から確認してください、それはあなたのコレクション名ですか？コレクション名の代わりにスキーマ名を使用したため、結果が空になりました。

{$lookup:
        {
          from: 'classes',  //check this
          localField: 'owner',//**String**
          foreignField: '_id', //**ObjectId**
          as: 'classes'
        }
      }