ほとんどの場合、複数のコレクションを作成するのではなく、1つのコレクションを使用して、サブスクリプションに応じてそのビューをクライアントに送信することをお勧めします。
私が作成したhttps://github.com/mizzao/meteor-partitionerパッケージを確認することをお勧めします。これは、この目的のために特別に設計されており、複数のチャットルームでこれを行う方法の例が含まれています。実装例については、https：//github.com/mizzao/CrowdMapperもご覧ください。