ほとんどの場合、これは長い読み取り/書き込みによるタイムアウトの結果です。
タイムアウトを増やすか、完全に削除してみてください:
MongoClientOptions.Builder options_builder = new MongoClientOptions.Builder();
options_builder.maxConnectionIdleTime(<some_long_time>);
MongoClientOptions options = options_builder.build();
MongoClient mongo_db = new MongoClient ("your.db.address", options);