$ concatは集約パイプラインであり、更新演算子/修飾子ではありません。
あなたがやろうとしていることは、次のことを行うことで達成できるようです:
db.col_1
.find({ "field_1": { $lt: 10000 } })
.forEach( function(i) {
db.col_1.update(
{ _id: i._id },
{ $set: { "field_1": "0" + i.field_1 } }
)
});