mongoDB 32ビット2GB制限、ベストプラクティス

シャーディングすることで2Gbの制限を超えることができます。 2Gbの制限は、シャーディングされたデータセットの合計データではなく、個々のmongodプロセスに適用されます。

こちら シャーディングの開始に関するドキュメントです。 シャードを設定するためのPythonスクリプトもあります単一のマシン上の環境 。 Windowsでも動作すると思います。