ドキュメントから。
batchSizeを渡すことができます AggregationOptionsを使用 SpringMongo2.xバージョン
Aggregation aggregation = newAggregation(unwind, group).withOptions(newAggregationOptions().cursorBatchSize(100).build());
デフォルトのバッチサイズで
Aggregation aggregation = newAggregation(unwind, group).withOptions(newAggregationOptions().cursor(new Document()).build());