_idによるマングースfindOne埋め込みドキュメント

サブドキュメントには.id（）メソッドがあるため、これを行うことができます：

myModel.findById(myDocumentId, function (err, myDocument) {
  var subDocument = myDocument.mySubdocuments.id(mySubDocumentId);
});

http://mongoosejs.com/docs/subdocs.html を参照してください。 参考のため。