マングース骨材ルックアップ-特定のIDでフィルタリングする方法

以下のaggregationを使用できます mongodbを使用3.6 以上

$matchを使用するだけです 最初の段階で親コレクションと同じように子コレクションを使用します。

db.BusinessCollection.aggregate([
  { "$match": { "clinics": { "$type": "array" }}},
  { "$lookup": {
    "from": "ClinicsCollection",
    "let": { "clinics": "$clinics" },
    "pipeline": [
      { "$match": {
        "$expr": {
          "$and": [
            { "$in": ["$_id", "$$clinics"] },
            { "$not": { "$eq": ["$_id", 1] }}
          ]
        }
      }}
    ],
    "as": "clinics"
  }}
])