一意のIDを持つ配列内のアイテムを更新しています

docs を参照してください アレイを更新するため。コードは次のようになります：

サーバー

Meteor.methods({
  'content.update.lastModified': function(contentId, peerId) {
    check(contentId, String);
    check(peerId, String);

    var selector = {_id : id, 'Peers.uniquePeer': peerId};
    var modifier = {$set: {'Peers.$.lastModified': 'Now'}};
    Content.update(selector, modifier);
  }
})

クライアント

Meteor.call('content.update.lastModified', contentId, peerId);

ご存知のように、クライアントではIDでのみドキュメントを更新できるため、この種の操作はサーバー定義のメソッドで実行する必要があることに注意してください。