tsフィールドは実際には
db.oplog.rs.find({ ts: Timestamp(1335200998000, 540)});
通常どおり$gteと$lteを使用できます:
db.oplog.rs.find({ ts: {$gte: Timestamp(1335100998000, 1)}});
db.oplog.rs.find({ ts: {$lte: Timestamp(1335900998000, 1)}});
2番目の引数は、指定された1秒以内の操作の増分序数です。