mongodbschema.createIndexは関数ではありません

マングースを使用しているようです。ボンネットの下で、

mongoシェルでは、collection.createIndex() 動作しますが、マングースではmySchema.index()を使用する必要があります 。マングースがその仕事をします。

詳細については、こちらをご覧ください： https://mongoosejs.com/docs/guide.html 。