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TypeError:ドキュメントの更新時にオブジェクト以外で呼び出されるObject.keys

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    変更することで問題を解決できました:

    User.findOne(req.user._id, function (err, user) { [...] });
    

    これに:

    User.findById(req.user._id, function (err, user) { [...] });
    


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