$ unwindの前に、サブドキュメントが空でないかどうかを確認してください

preserveNullAndEmptyArraysを追加する必要があります $unwind内のプロパティ このような操作：

{
 $unwind:
  {
    path: "$applications",
    preserveNullAndEmptyArrays: true
  }
}

$ unwind