JPAは、ネイティブクエリではなく、JPQLクエリでのみリストリテラルパラメータとしてのコレクションの使用をサポートします。一部のJPAプロバイダーは独自の機能としてサポートしていますが、JPA仕様の一部ではありません(https://stackoverflow.com/a/3145275/1285097を参照)。
ネイティブクエリの名前付きパラメータもJPA仕様の一部ではありません。それらの動作は、永続性プロバイダーやJDBCドライバーによって異なります。
Oracle用のJDBCドライバーでHibernateは、これらの機能の両方をサポートします。
List<String> selectedValues = Arrays.asList("STRING1", "STRING2");
final String parameterizedQuery = "select * from SOMETABLE where SOMEFIELD in (:selectedValues)";
return em.createNativeQuery(parameterizedQuery)
.setParameter("selectedValues", selectedValues)
.getResultList();