Flywayの修復では、データベースは修復されません（こちらのドキュメントを参照 ）。スキーマ履歴テーブルを有効な状態に修復します。データベースの修正はユーザーに任されています（これは簡単な作業ではないため）。
この状況では、commit;を送信してみてください。 。これにより、修復を実行してから再度移行できるようになります。参照： https://dbaclass.com/article/ora-12838-cannot-readmodify-object-modifying-parallel/