Spring DataJPA2.0.9リリースの複数のデータベース構成

ベースパスを変更することで問題を解決しました。正常に機能しています。

私のセカンドクラス、

@ConditionalOnProperty(name = "embedded", havingValue = "true", matchIfMissing = true)
@Configuration
@EnableTransactionManagement
@EnableJpaRepositories(entityManagerFactoryRef = "dataSyncEntityManagerFactory", transactionManagerRef = "dataSyncTransactionManager", basePackages = {
        "kgfsl.rms.datasync" })
public class JPADataSyncConfig {